Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Gm21887J3QQ04 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm3269-201ENSMUST00000166025 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Aebp2-205ENSMUST00000160836 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm21887J3QQ04 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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