Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm8888J3QPX5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms