Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21900J3QP38 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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