Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm3415J3QMS8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3415J3QMS8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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