Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11236J3QMS7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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