Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930544D05RikJ3QK56 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms