Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cldn34c3J3QJW5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c3J3QJW5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms