Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm17535J3KMR8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17535J3KMR8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm17535J3KMR8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17535J3KMR8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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