Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r67G5E8C1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms