Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ScaperF8VQ70 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ScaperF8VQ70 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms