Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8005F6YKY3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms