Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Zfp988F6VKC7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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