Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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