Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm340F6RGI3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms