Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rdh16f1E9Q9P8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rdh16f1E9Q9P8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rdh16f1E9Q9P8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rdh16f1E9Q9P8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rdh16f1E9Q9P8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rdh16f1E9Q9P8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rdh16f1E9Q9P8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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