Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A430078G23RikE9Q7Y4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms