Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf169E9Q7F2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf169E9Q7F2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf169E9Q7F2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf169E9Q7F2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf169E9Q7F2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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