Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc85cE9Q6B2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85cE9Q6B2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85cE9Q6B2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms