Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BC005561E9Q5E2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BC005561E9Q5E2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms