Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Myo5cE9Q1F5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Myo5cE9Q1F5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Myo5cE9Q1F5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Myo5cE9Q1F5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Myo5cE9Q1F5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
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Myo5cE9Q1F5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Myo5cE9Q1F5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Myo5cE9Q1F5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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