Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Ryr1E9PZQ0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms