Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Brd1E9PZ26 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms