Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms