Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm3002E9PW72 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3002E9PW72 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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