Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc175E9PVB3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms