Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc6D3YZP9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc6D3YZP9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms