Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc170D3YXL0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms