Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Phf11cB4XVP9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Phf11cB4XVP9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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