Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Usf3B2RUQ2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Usf3B2RUQ2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Usf3B2RUQ2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usf3B2RUQ2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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