Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprbB2RU80 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprbB2RU80 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprbB2RU80 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprbB2RU80 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms