Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Apol7aB2RT54 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apol7aB2RT54 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms