Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grik3B1AS29 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms