Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmem235B1AQL3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms