Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem238A9JSM3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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