Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm6880A3KG45 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6880A3KG45 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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