Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtcflA2APF3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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