Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rhbdl2A2AGA4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhbdl2A2AGA4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms