Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Frmpd4A2AFR3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Frmpd4A2AFR3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms