Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp8nlA2ABX0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbbp8nlA2ABX0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms