Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms