Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cul4bA2A432 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cul4bA2A432 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms