Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5538W4VSP6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5538W4VSP6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms