Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP4

Serpinb6c, Serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6cW4VSP4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Serpinb6cW4VSP4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Serpinb6cW4VSP4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms