Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Crlf3Q9Z2L7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Crlf3Q9Z2L7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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