Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stau1Q9Z108 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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