Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx1Q9WV80 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms