Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV76

Ap4b1, AP-4 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4b1Q9WV76 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ap4b1Q9WV76 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms