Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf13bQ9WU72 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms