Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Usp18Q9WTV6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp18Q9WTV6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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