Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plod3Q9R0E1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms